在Linux系统中，高效备份MongoDB数据库的方法是使用mongodump和mongorestore工具。这两个工具可以帮助你创建数据库的完整备份，并在需要时恢复数据。以下是使用这两个工具进行备份和恢复的步骤：

使用mongodump备份数据库：

首先，确保你已经安装了MongoDB，并且mongodump命令可用。然后，运行以下命令来备份指定的数据库：

mongodump --host <hostname> --port <port> --username <username> --password <password> --authenticationDatabase admin --db <database_name> --out <output_directory>

其中，<hostname>、<port>、<username>、<password>、<database_name>和<output_directory>分别表示MongoDB服务器的主机名、端口、用户名、密码、要备份的数据库名称以及备份文件的输出目录。

例如：

mongodump --host localhost --port 27017 --username myUser --password myPassword --authenticationDatabase admin --db myDatabase --out /backups/myDatabase

使用mongorestore恢复数据库：

如果你需要从备份中恢复数据库，请使用以下命令：

mongorestore --host <hostname> --port <port> --username <username> --password <password> --authenticationDatabase admin --db <database_name> <input_directory>

其中，<hostname>、<port>、<username>、<password>、<database_name>和<input_directory>分别表示MongoDB服务器的主机名、端口、用户名、密码、要恢复的数据库名称以及备份文件的输入目录。

例如：

mongorestore --host localhost --port 27017 --username myUser --password myPassword --authenticationDatabase admin --db myDatabase /backups/myDatabase/myDatabase

注意事项：

在执行备份和恢复操作时，建议关闭正在运行的MongoDB实例，以确保数据的一致性。如果你的数据库非常大，可以考虑使用--gzip选项来压缩备份文件，以节省存储空间和提高传输速度。定期执行备份操作，并将备份文件存储在安全的位置，以防止数据丢失。在恢复数据之前，请确保目标数据库不存在，或者已经清空，以避免数据冲突。