秦始皇杀嫪毐的原因有三：

第一、吕不韦为了摆脱赵太后的纠缠、避免自己被正在成年的秦王嬴政清算而献出嫪毐。而嫪毐入宫之后很快得到赵太后的宠幸，他们二人甚至生育了两个孩子。这种宫廷丑闻，嬴政是难以接受的，所以，嫪毐终究逃不过一死。

第二、嫪毐凭借赵太后的宠幸很快得到了权力，他被封为长信侯，并且太后之“事皆决于嫪毐。嫪毐家僮数千人，诸客求宦为嫪毐舍人千余人。”除了实际掌握了大权之外，嫪毐可能还在策划更大的阴谋——秦始皇九年，有人告发嫪毐与赵太后密谋“王即薨，以子为后”。而且，嫪毐最终发动了宫廷政变，谋反篡位铁证如山，嬴政岂能容忍？所以，嫪毐终究逃不过一死。

第三、给嫪毐拉啤条的人是谁，是权倾天下的仲父吕不韦啊！当嬴政成年之后，吕不韦已经敏感地觉察到自己应该让权了，他已经敏感地察觉到自己终究不是嬴政的对手，所以他才用嫪毐脱身，最终嫪毐李代桃僵，但是嬴政没有忘记，他最终要对付的不是嫪毐这个跳梁小丑，而是任何阻挡他得到天下大权的人，而吕不韦正是嬴政最大的敌人。所以，为了对付吕不韦，嫪毐终究逃不过一死。并且，嫪毐死后，“王欲诛相国，为其奉先王功大，及宾客辩士为游说者觽，王不忍致法”，嬴政没有“不忍”太久，就赐死了吕不韦。